นกอินทรีฟิลิปปินส์แต่ละตัวนำวัสดุต่างๆ

นกอินทรีฟิลิปปินส์แต่ละตัวนำวัสดุต่างๆ มาจนรังสมบูรณ์ จากนั้นจึงเริ่มผสมพันธุ์ได้ ตัวเมียวางไข่หนึ่งฟองทุกๆ นกอินทรี สองปี ไข่จะถูกฟักสลับกันโดยพ่อแม่นกอินทรีทั้งสองตัวเป็นเวลาประมาณหกสิบวัน นกอินทรีตัวผู้ออกล่ามากที่สุดในช่วงเดือนแรกๆ ของชีวิต ขณะที่ตัวเมียจะอยู่กับลูกอ่อน พ่อแม่ทั้งสองเลี้ยงดูลูกหลานจนสามารถเลี้ยงตัวเองได้ก่อนที่จะออกลูกอีกครั้ง